Lors du processus d’aération, de l’air extérieur est ajouté à l’eau par voie de diffusion. La diffusion distribue l’air sous la forme de fines bulles. Celles-ci permettent de transférer de l’oxygène dans l’eau. Le flux d’air génère un débit d’eau. Le débit ainsi créé peut servir à mélanger l’eau et/ou garder les composants présents dans l’eau en suspension (éviter les dépôts). Un fort débit d’air insufflé dans l’eau peut également être utilisé pour éliminer (évacuer) les gaz tels que le méthane ou le sulfure d’hydrogène. L’aération peut enfin créer un écran de bulles au travers duquel les constituants ne pourront pas passer.